重磅!僅需1萬個細胞,安諾Hi-C建庫再降門檻
2019.03.08

2018年底,安諾基因成功推出了10萬個細胞水平的Hi-C建庫,率先實現了低起始量Hi-C建庫的產業化服務。僅僅2個月,2019年剛剛開啟,安諾研發再傳捷報,1萬個細胞Hi-C建庫成功交付!小編不禁感嘆,地球不爆炸,研發不下架,宇宙不重啟,研發不停息~ 安諾Hi-C沒有四季,專注提升硬實力,天天都是奮斗季~

 

樣本要求

 

樣本類型:細胞(人、鼠或其他物種)

建庫起始量:1萬個交聯細胞樣本/文庫

測序平臺:Illumina HiSeq X Ten,PE150

 

文庫質控

 

我們對10多例人和小鼠的細胞樣本進行了穩定性測試,評估結果顯示,最終可用于分析的Valid Rate(%)均在55%以上,最高可達82%,有效數據比例依舊杠杠滴~ 部分樣本文庫質控結果如下(小數據測試結果):

 

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cis/trans interaction比例統計

 

判斷Hi-C文庫是否合格的一個重要指標是cis/trans比值,cis指的是pairedreads在同一條染色體上(intra-chromosomal interactions),trans指的是paired reads在不同染色體上(inter-chromosomal interactions)。一般認為cisinteraction比例越高,表明該數據的質量越好。我們的統計結果顯示,測試樣本cis rate(%)均在80%以上,數據質量良好。

 

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交互熱圖結果展示

 

對小數據結果進行交互熱圖分析,如下圖所示,展示了genome-wide Hi-C交互熱圖。

 

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相比于10萬個細胞的建庫水平,1萬個細胞Hi-C建庫的成功研發讓更多生殖和腫瘤等研究領域的微量樣本染色質構象解析成為可能極大拓展了Hi-C這項前沿技術的應用范圍和使用人群,也為更多的科研工作者攻克生命科學領域的未解難題提供了新思路。

 

1萬個細胞建庫遠不是我們的終點,安諾Hi-C研發團隊一直致力于解決珍稀樣本的建庫問題,讓我們相約下一個突破性進展吧~

 

 

 

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